Тъй като всички адсорбционни процеси са екзотермични, те причиняват повишаване на температурата, което не е желателно за адсорбцията на органични съединения. Въглеродът или металите върху GAC, както и зеолитите могат да катализират окисляването на някои съединения, когато адсорбентът е горещ, което води до пожари в пласта, които също консумират част или целия GAC, но не и зеолита. Това представлява опасност при адсорбиране на някои въглеводороди (като кетони или сравними активни съединения) при температури на околната среда, близки до тези, които причиняват окисляване на органичното съединение. Такъв пожар в GAC леглото може или да промени размера на порите на останалата част от слоя, или да окисли слоя до пепел, което е сериозен инцидент, който може да изгори цялото съоръжение. Тези пожари могат да бъдат потушени чрез овлажняване на въздуха и чрез умишлено охлаждане на GAC.

Необходим е мониторинг на температурата на изхода на газ от GAC адсорбера, за да се предотврати опасността от пожар. Друго важно измерване е спадът на налягането в слоя адсорбент. Навсякъде в леглото налягането трябва да остане приблизително постоянно. Трябва да има аларма за високо налягане.