Com que tots els processos d'adsorció són exotèrmics, provoquen un augment de la temperatura, cosa que no és desitjable per a l'adsorció de compostos orgànics. El carboni o els metalls del GAC, així com de les zeolites, poden catalitzar l'oxidació d'alguns compostos quan l'adsorbent és calent, provocant incendis al llit que també consumeixen part o la totalitat del GAC, però no la zeolita. Això suposa un perill quan s’absorbeixen determinats hidrocarburs (com les cetones o compostos actius comparables) a temperatures ambientals properes a les que provoquen l’oxidació del compost orgànic. Aquest foc de llit GAC pot alterar la mida dels porus de la resta del llit o oxidar el llit en cendra, que és un incident greu que pot cremar tota la instal·lació. Aquests incendis es poden suprimir per humidificació de l’aire i per refredament intencionat del GAC.

Es requereix un control de la temperatura de la sortida de gas de l’adsorbent GAC per evitar el risc d’incendi. Una altra mesura important és la caiguda de pressió sobre el llit adsorbent. A través del llit, la pressió ha de romandre aproximadament constant. Hauria d’haver-hi una alarma en cas d’alta pressió.