Da alle Adsorptionsprozesse exotherm sind, verursachen sie einen Temperaturanstieg, der für die Adsorption organischer Verbindungen unerwünscht ist. Kohlenstoff oder Metalle auf GAC sowie Zeolithe können die Oxidation einiger Verbindungen katalysieren, wenn das Adsorptionsmittel heiß ist, was zu Bettbränden führt, die auch einen Teil oder das gesamte GAC verbrauchen, aber nicht den Zeolith. Dies ist gefährlich, wenn bestimmte Kohlenwasserstoffe (wie Ketone oder vergleichbare Wirkstoffe) bei Umgebungstemperaturen adsorbiert werden, die nahe denen liegen, die eine Oxidation der organischen Verbindung bewirken. Ein solches GAC-Bettfeuer kann entweder die Porengröße des Rests des Betts verändern oder das Bett zu Asche oxidieren, was ein schwerwiegender Vorfall ist, der die gesamte Anlage niederbrennen kann. Diese Brände können durch Befeuchtung der Luft und durch gezielte Kühlung des GAC unterdrückt werden.

Eine Temperaturüberwachung des Gasausgangs des GAC-Adsorbers ist erforderlich, um Brandgefahr zu vermeiden. Eine weitere wichtige Messung ist der Druckabfall über das Adsorptionsmittelbett. Über das Bett hinweg sollte der Druck ungefähr konstant bleiben. Bei hohem Druck sollte ein Alarm ausgelöst werden.