El biotrickling funciona en condiciones similares al biodepurador pero, a diferencia del biodepurador, los microbios se fijan en elementos de soporte.

En un reactor biológico de lecho percolador, se hace circular continuamente una fase acuosa a través de un lecho de material inerte. Este empaque puede constar de material a granel irregular, como anillos, monturas, etc. o de empaque estructurado. Al seleccionar el material de empaque, es necesario en todos los casos asegurarse de que, incluso en el caso de una formación de lodo excesivo anticipado, el reactor no se ahogue a largo plazo.

Las propiedades de la superficie deben ser tales que la biopelícula se adhiera firmemente. Los contaminantes del gas residual y el oxígeno son absorbidos por la fase acuosa y transportados al biofilm, donde tiene lugar la transformación biológica. La calidad de la transferencia de masa del gas a la fase líquida y el rendimiento de eliminación del reactor dependen esencialmente del área de la superficie mojada del empaque. Para lograr resultados de eliminación óptimos, es decir, para maximizar el área superficial humedecida, la fase líquida debe distribuirse uniformemente sobre la superficie de la biopelícula.

La inmovilización de la biomasa y la formación de la biopelícula son generalmente un proceso naturalmente controlado que comienza después de la inoculación de la fase acuosa. La fase líquida en circulación continua asume la función de suministrar a la población microbiana los nutrientes necesarios. Al mismo tiempo, el lodo activado en exceso y los productos de reacción que también pueden ser inhibidores, por ejemplo, cloruro de hidrógeno durante la degradación del diclorometano, se eliminan del reactor por lavado. En la fase líquida, es necesario controlar las condiciones esenciales como el pH, los nutrientes y la acumulación de sal.