A biodegradação funciona em condições semelhantes à bioscrubbing, mas, em contraste com a bioescrubagem, os micróbios são fixados em elementos de suporte.

Em um reator biológico de leito residual, uma fase aquosa é continuamente circulada através de um leito de material inerte. Esta embalagem pode ser constituída por material a granel irregular, como anéis, selas, etc. ou por embalagem estruturada. Ao selecionar o material de embalagem, é necessário, em todos os casos, garantir que, mesmo no caso de uma formação de lama excessiva prevista, o reator não ficará obstruído a longo prazo.

As propriedades da superfície devem ser tais que o biofilme adere a ela com firmeza. Os poluentes do gás residual e do oxigênio são absorvidos pela fase aquosa e transportados para o biofilme, onde ocorre a transformação biológica. A qualidade da transferência de massa da fase gasosa para a fase líquida e o desempenho de eliminação do reator dependem essencialmente da área de superfície molhada da embalagem. Para obter resultados de eliminação ideais, ou seja, para maximizar a área de superfície umedecida, a fase líquida deve ser distribuída uniformemente sobre a superfície do biofilme.

A imobilização da biomassa e a formação do biofilme são geralmente processos controlados naturalmente que se iniciam após a inoculação da fase aquosa. A fase líquida em circulação contínua assume a função de fornecer à população de micróbios os nutrientes necessários. Ao mesmo tempo, o excesso de lodo ativado e produtos de reação que também podem ser inibidores, por exemplo, cloreto de hidrogênio durante a degradação do diclorometano, são lavados para fora do reator. Na fase líquida, as condições essenciais como pH, nutrientes e acúmulo de sal precisam ser controladas.