Tous les processus d'adsorption étant exothermiques, ils provoquent une élévation de température, ce qui n'est pas souhaitable pour l'adsorption de composés organiques. Le carbone ou les métaux sur CAG ainsi que les zéolithes peuvent catalyser l'oxydation de certains composés lorsque l'adsorbant est chaud, entraînant des feux de lit qui consomment également une partie ou la totalité du CAG, mais pas la zéolite. Il s'agit d'un danger lors de l'adsorption de certains hydrocarbures (tels que les cétones ou composés actifs comparables) à des températures ambiantes proches de celles qui provoquent l'oxydation du composé organique. Un tel feu de lit GAC peut soit modifier la taille des pores du reste du lit, soit oxyder le lit en cendres, ce qui est un incident grave qui peut brûler toute l'installation. Ces incendies peuvent être supprimés par humidification de l'air et par refroidissement intentionnel du CAG.

La surveillance de la température de la sortie de gaz de l'adsorbeur GAC est nécessaire pour prévenir les risques d'incendie. Une autre mesure importante est la chute de pression à travers le lit d'adsorbant. À travers le lit, la pression doit rester à peu près constante. Il devrait y avoir une alarme pour haute pression.